Высшим органом МГС СМС является заседание членов МГС, который проводится в год два раза.

Согласно уставу, деятельность председателя осуществляется последовательно каждым членом Совета на основе ротации. Председатель руководит заседания Совета и организует работы в течение времени между заседаниями.

Для выполнения работ Совета и подготовки материалов для исполнительного комитета членов СНГ создан Бюро по стандартам, который свою деятельность осуществляет согласно Уставу утвержденным Советом. Работы по межгосударственной стандартизации организует и ведет межгосударственный Совет по стандартизации, метрологии и сертификации согласно установленным правилам и процедурам. Членами Совета являются руководители национальных органов СМС, участники государств Соглашения

Совет тесно сотрудничает с исполнительным комитетом СНГ, с Межгосударственной Ассамблеей участников государств членов СНГ, а так же с межгосударственными отраслевыми органами СНГ, действующими в научно-технологических областях - с Межгосударственной комиссией по научно-технологическому развитию (МК НТР), с Межгосударственным советом по координированию научно-технологической информацией (КНТИ МГС), с Межгосударственным советом (ВСПС МГС) по вопросам сохранения промышленной собственности.

Совет сотрудничает с Европейской экономической комиссией (ЕЭК ООН), с Международной организацией по стандартизации (ИСО), с Европейским комитетом по стандартизации (СЕН).

Межгосударственный совет по стандартизации, метрологии и сертификации со стороны ИСО признана как Евразийская региональная организация по стандартизации (EASC).

Согласно межгосударственного соглашения, Совет осуществляет координацию работ по ведению согласованной политики в области стандартизации, метрологии и сертификации и аккредитации, выполняя следующие основные функции:

- принятие общих правил проведения работ по стандартизации, метрологии и сертификации, представляющих межгосударственный интерес;

- установление единых обязательных требований к продукции и услугам, обеспечивающих их безопасность для жизни и здоровья человека, охрану окружающей среды, совместимость и взаимозаменяемость, а также единых методов испытаний;

- стандартизация общетехнических требований, представляющих межгосударственный интерес;

- организация ведения и развития классификаторов технико-экономической информации и систем кодирования;

- установления единиц физических величин, допускаемых к применению в государствах-участниках Соглашения;

- ведение межгосударственной службы времени и частот, информационных фондов средств измерений, стандартных образцов и стандартных справочных данных;

- ведение и развитие эталонной базы и системы передачи размеров единиц физических величин;

- формирование, хранение и ведение фонда межгосударственных стандартов, международных, региональных и национальных стандартов других стран и обеспечение участников Соглашения этими стандартами;

- взаимное признание результатов государственных испытаний, метрологической аттестации, проверки и калибровки средств измерений;

- взаимное признание аккредитованных испытательных, поверочных, калибровочных и измерительных лабораторий (центров), органов сертификации, сертификатов на продукцию и систем обеспечения качества;

- издание, переиздание, тиражирование и распространение межгосударственных стандартов, международных и региональных стандартов, других нормативных документов по стандартизации, метрологии и сертификации, представляющих межгосударственный интерес;

- координация программ подготовки и повышения квалификации кадров в области стандартизации, метрологии и сертификации;

- международное сотрудничество в области стандартизации, метрологии, сертификации и качества.